激光手术治近视眼有后遗症的可能，常见的后遗症有感染、干眼症、屈光回退、炫光及视觉质量下降等。
感染：是常见的后遗症，如果激光手术后不注意用眼卫生，未按医嘱规律用药，或合并外伤等病变时，容易发生角膜感染。
干眼症：激光手术可能会损伤传入感觉神经纤维，导致基础泪液分泌减少，就会引起干眼情况发生。也可能与术后炎症因子持续作用有关。
屈光回退：激光手术后如果角膜伤口愈合反应过强，或术后日常生活中不正确的用眼习惯等，都可能导致视力下降、屈光回退，近视再次复发的现象。
炫光及视觉质量下降：激光手术治近视眼时手术区域的直径大约是6.5mm，当晚上瞳孔扩大时，视野超过了6.5mm的区域，这时手术区域内能看清楚，手术区域外看不清楚，就会出现炫光及视觉质量下降现象。
激光手术治近视眼一般术后效果较好，需根据具体情况具体评估，规范治疗可明显减少手术后遗症的发生。