晶体植入术和全飞秒手术都属于近视矫正手术，各有利弊，不存在哪个更好的问题，只是哪种手术更适合患者。
如果是中低度近视患者或者部分的高度近视患者，例如八百度以下的近视患者，可以考虑做全飞秒手术。全飞秒手术是完全利用飞秒激光完成的手术，它最大的优点是不需要制作角膜瓣，不用担心外伤所引起的角膜瓣移位的风险，同时其手术切口较小，所以微切口术后恢复时间较短，只要严格把握好手术适应证，全飞秒手术矫正近视非常安全。
但是它有一些不足之处，例如全飞秒手术矫正的范围较窄，通常适用于八百度以下的近视患者，对于超过一千度的近视患者，由于其角膜厚度可能不够，所以无法接受飞秒手术进行治疗，这时候有晶体眼的人工晶状体植入手术可以弥补这种不足。与白内障手术中应用的人工晶状体不同，此类手术并不是用于代替人本身的晶状体，而是将人工晶状体置于虹膜和自然晶状体之间作为一种屈光的补充，但是它有一些不足，例如少数人可以在术后导致白内障或者青光眼的发生，所以说晶体植入术和全飞秒手术各有利弊。