全飞秒术后眼睛酸胀疼一般是手术未恢复、眼疲劳、角结膜干燥症、结膜炎、角膜炎等原因引起的，需要做好眼部卫生，防止眼部感染。
1、手术未恢复：全飞秒手术属于一种激光治疗方法，能够提升视力，通常会对眼部造成刺激，容易出现眼睛酸胀或者疼痛，需要一周到两周恢复，如果处于恢复期间，出现眼睛轻度酸胀属于正常，需要多注意休息。
2、眼疲劳：可能是术后过度用眼或者看电子产品导致眼部疲劳，引起眼睛酸胀或者疼痛，需要通过眼部热敷改善。
3、角结膜干燥症：可能是手术操作时造成角膜神经损伤，引起泪腺不能及时分泌泪液，引起的眼睛干涩疼痛。需要遵医嘱使用玻璃酸钠滴眼液、聚乙烯醇滴眼液等药物治疗。
4、结膜炎：可能是过敏或者细菌感染，引起结膜充血或者肿胀，引起酸胀、疼痛或者瘙痒等症状。可以根据医生指导服用阿莫西林胶囊或者氯雷他定片等药物治疗，能够达到消炎和抗过敏作用。
5、睑腺炎：一般是眼部卫生不大导致细菌侵入引起睑腺炎，通常做完全飞秒术后会引起眼睛酸胀疼痛或者灼热等症状。可以配合医生选择妥布霉素滴眼液或者盐酸左氧氟沙星滴眼液等药物治疗，能够达到抗菌和消炎作用。
需要明确实际情况，采取相对应的治疗方法。