飞秒激光近视眼手术可能会有后遗症，一般不多见。
飞秒激光近视眼手术是利用飞秒激光切割患者的角膜组织，达到近视矫正的目的，主要包括半飞秒手术和全飞秒手术。半飞秒手术是用飞秒激光切割角膜上的角膜瓣，然后抬起角膜瓣，再用准分子激光精确切割角膜基质，最后恢复角膜瓣。全飞秒手术是通过激光穿过角膜表面，在角膜基质层内部，制作出具有一定厚度的角膜基质透镜，并通过2mm的微切口取出透镜，以改变角膜的曲率和折射光的能力，从而改善近视。飞秒激光近视手术常见的后遗症包括干眼症、视力回退等，护理不当还有可能会出现局部感染，如果遵医嘱做好护理，选择正规的机构进行治疗，后遗症一般不多见，不需要担心。
飞秒激光近视手术受手术方式、地域等因素的影响，通常需要15000至20000元，术后半年左右可以恢复，一般可以长久维持，患者术后注意用眼健康，防止眼部疲劳。