一般来说，做全飞秒激光手术的利是能够改善视力，摆脱近视。弊就是存在感染的风险，但全飞秒激光手术的感染风险较小。其次由于全飞秒激光手术是在患者的角膜基质内完成切割的过程，在一定程度上会损伤角膜基质内的神经纤维，从而产生部分不良功能，如分泌泪液欠佳导致术后干眼症，患者术后眼睛疼痛等，但此类情况较为少见。全飞秒激光手术后，可能导致部分高度或超高度近视患者在术后一段时间再次出现新的近视度数，此类后遗症较为常见。
术后建议患者保持良好的心态，避免摄入辛辣刺激性食物，忌烟忌酒，多吃新鲜的水果蔬菜，补充足够的维生素，同时要保持充足的休息和睡眠，避免眼睛疲劳。如果出现任何不适症状，建议患者及时前往医院就医。