任何手术都是有风险的，所以近视手术也有副作用也就是并发症。
第一、过矫、欠矫、屈光回退，就是做完手术过了一段时间后，看东西又模糊了。
第二、包括干眼症、眩光、光晕，特别是干眼症，经常有些在手术完的两三个月，此情况还比较明显。
第三、角膜并发症，比如角膜上皮内生、弥漫性层间角膜炎等等，均需要进行对症治疗和处理。
由于近年来手术器械、围手术期管理、手术设计方案的改良，特别是目前最新的两大术式：飞秒激光辅助制瓣的准分子激光原位角膜磨镶术和是SMILE术，均属微创手术。
上述并发症少见。即使有，也是在短期内能够迅速的得到有效控制，所以安全系数是非常高了。