半飞秒后一只眼睛清晰一只模糊可能与手术操作方法不当有关，也有可能是手术副作用所造成，需要针对发病原因采取治疗措施。
1、手术操作方法不当：半飞秒激光手术通常是利用激光爆破的原理，然后制作角膜瓣，并且对角膜基质进行切削，能够改变角膜曲率，从而可以达到矫正近视的效果，如果切除角膜组织过多出现褶皱的情况，就有可能会导致一只眼睛清晰一只模糊，可以通过复位手术的方法进行改善。
2、手术副作用：如果在半飞秒手术之后没有注意做好眼部的清洁卫生，导致一只眼睛发炎感染，也有可能会出现一只眼睛清晰一只模糊的现象，可以配合医生使用左氧氟沙星滴眼液进行治疗。