全飞秒近视手术一般不合并后遗症，但是由小部分人可能会有后遗症，说明如下：
1、术后肝炎：全飞秒近视激光手术以后，部分患者在术后早期可以伴随出现眼睛干涩的症状，可能是患了干眼症。飞秒激光手术会切断角膜前基质层内的感觉神经，术后早期会导致角膜知觉减退。角膜知觉的减退可以导致眼睛瞬目反射减少，从而导致基础分泌泪液减少。泪液减少在早期可以导致干眼症，但是随着时间大部分患者可以恢复；
2、近视度数反弹：大部分全飞秒近视手术后的患者，可以保持良好的屈光状态，但是部分患者由于自身的原因，或者用眼不当可以导致近视反弹；
3、其他后遗症：例如合并眩光、夜晚视觉质量差等症状。