做近视眼手术的后遗症主要包括以下几点：
1、破坏眼表细胞结构：因为眼睛是有很多细胞组成的，例如蛋白层、水液层、脂质层等组织，这些组织会分泌一些蛋白质、泪膜等物质，这些物质会覆盖在角膜上，使眼睛不会产生干燥感，但是通过手术后就会破坏这些细胞，从而眼睛就会失去保护，比较容易干燥、酸涩，长时间就会导致一些眼部疾病的产生，平时可以通过玻璃酸钠滴眼液、人工泪液眼药水等方式进行缓解。
2、容易出现炫光：因为在手术时会将角膜进行处理，所以很容易造成手术后眼睛出现炫光的情况，因为光线会出现在视网膜之外，所以就会出现炫光，这种情况平时需要注意休息，避免长时间用眼，多喝水，然后慢慢习惯就好。
3、容易出现眼部疾病：因为手术会破坏眼睛的组织结构，所以术后如果处理不当就会造成角膜炎、角膜扩张等问题，这时就需要通过抗生素眼药水、激素类眼药水进行缓解，如：氧氟沙星滴眼液、阿昔洛韦滴眼液、地塞米松磷酸钠滴眼液等。