全飞秒手术通常是指全飞秒激光手术。通常没有“北京做全飞秒激光手术最好的医院是哪家”这种说法。一般情况下，北京做全飞秒激光手术比较好的医院有中国医学科学院北京协和医院、首都医科大学附属北京同仁医院、北京大学人民医院。具体分析如下：
1、中国医学科学院北京协和医院：该医院是一所集医疗、科研、教学为一体的大型综合医院，拥有一支专业眼科团队，配备先进的设备和技术，可以提供多种眼科手术，包括全飞秒激光手术。
2、首都医科大学附属北京同仁医院：该医院在眼科领域具有广泛的声誉和经验，拥有一支由国内外知名专家组成的眼科团队，在屈光不正方面进行了大量的临床研究，可以进行全飞秒激光手术。
3、北京大学人民医院：该医院是一所国家重点大学附属医院，其眼科拥有高水平的眼科医生和技术团队，提供全面的眼科诊疗服务，是一家全飞秒激光手术做得比较好的医院。
如果想做全飞秒激光手术，建议前往正规医院咨询专业医生，了解手术效果、风险、费用等。