全飞秒手术即为全飞秒激光近视矫正手术，主要是利用飞秒激光，在角膜基质进行透镜形状的精确切割与制作，手术存在一定后遗症，如屈光度数回退、欠矫或过矫，以及干眼症、角膜炎等。但总体来说，全飞秒激光近视矫正手术无需制作角膜瓣，可减少及避免角膜瓣制作的相关并发症，所以需要做全飞秒激光近视矫正手术的人群无需过分担心。
1、屈光度数回退、欠矫或过矫：少数屈光度数较高的患者，以及术前屈光状态不稳定的患者，可能会导致术后出现屈光度数下降，还会伴有欠矫或过矫的情况。需要密切随访屈光度数的变化，在其完全稳定的情况下，可考虑进行加强手术或表层手术等；
2、干眼症：可能是由于局部用药、睑板腺功能异常，以及既往存在干眼症和手术损伤等因素引起，患者可采取热敷、按摩，以及遵医嘱局部使用玻璃酸钠滴眼液、硫酸软骨素滴眼液等药物缓解眼睛干涩；
3、角膜炎：可能是由于术中或术后感染导致，术中主要是手术源性感染，术后是患者配合不好，如没有按时用药，没有按照医生的要求洗脸、洗头等，促使眼睛受到污染。患者可能会出现眼睛疼痛、畏光、流泪、异物感等症状，可遵医嘱使用妥布霉素滴眼液、盐酸金霉素眼膏、环孢素滴眼液等药物治疗。
此外，还可能会出现角膜形态改变等情况，但发生的可能性相对较小。建议进行全飞秒激光近视矫正手术的患者谨遵医嘱，并保持充足睡眠，避免用眼过度。同时还应按时换药，避免感染，尽可能降低后遗症发生的概率。