做半飞秒手术后遗症有可能会导致眼部继发性的感染，甚至还会导致矫正不足和矫正过度。做完半飞秒手术之后，如果没有做好眼部的卫生及护理工作，就有可能会导致眼睛受到细菌和病毒的感染，容易造成结膜炎和角膜炎，还会伴有眼睛红肿以及疼痛的症状。同时手术操作不正确的还有可能会造成矫正过度。
