全飞秒手术目前是一种比较完善、效果很好的手术方式，一般不会有后遗症，但是小部分人可能会有后遗症，说明如下：
1、近视度数反弹：大部分患者全飞秒激光术后，可以保持良好的屈光状态，但是部分患者由于自身的原因或者用眼过度不当，会导致近视反弹；
2、术后干眼：飞秒激光手术后，部分患者在术后早期可以出现眼睛干涩的症状，可能是患了干眼症。飞秒激光会切断角膜前基质层内的感觉神经丛，术后早期会导致角膜知觉减退，引起瞬目反射减少，从而导致基础分泌泪液减少，在术后早期可以导致干眼症，随着时间的延长大部分人可以恢复；
3、其他后遗症：可以合并眩光、夜间视觉质量差等症状，极少部分患者因为用眼不当或者是因为其他因素，可以导致角膜的感染。