全飞秒与半飞秒的区别，主要是在角膜的操作上的不一样。
1.全飞秒：全飞秒手术是通过激光，透过角膜的表层，在角膜基质层里边，用激光做出一个一定厚度的角膜基质透镜，通过一个两毫米的微切口，将透镜取出来，改变角膜的曲率和对光线折射的能力，从而达到摘掉眼镜改掉近视的目的。
2.半飞秒：半飞秒手术是通过飞秒激光在角膜上切出一个大约100微米的角膜瓣，然后再将角膜瓣掀起，再通过准分子激光对角膜基质进行精确切削，最后将角膜瓣复位。该术式需要首先切开一个角膜瓣，因此对角膜力学的改变相对于全飞秒手术更高。
患者可根据术前检查，来选择适合自己的术式。