高度近视眼睛疼应根据具体病因选择合适的治疗方式，可能与视疲劳、青光眼或干眼症等有关，需要通过适当休息、使用药物的方式治疗。
1、视疲劳：高度近视患者眼球变形，长期过度用眼可能会造成眼睛疲劳敏感，就会出现眼睛疼痛的症状。需要通过适当休息、减少用眼时间来改善症状，促进恢复。
2、干眼症：高度近视患者在患该病后可能会出现泪腺分泌减少的情况，并出现眼痛症状。应遵医嘱使用地夸磷索钠滴眼液、羟糖甘滴眼液、玻璃酸钠注射液等药物治疗。
3、青光眼：患病后会导致眼压增高，从而出现眼睛痛、头痛、眼胀的表现。患者可以在医生的指导下使用毛果芸香碱滴眼液、布林佐胺滴眼液、酒石酸溴莫尼定滴眼液等药物，可降低眼压，促进恢复。
除上述因素外，也可能是由角膜炎、咽蜂窝织炎、急性虹睫炎等因素导致的，应及时前往眼科就诊检查，明确具体病因。