近视眼患者在进行飞秒激光手术时需要先测量患者眼部各项参数，制定手术方案，随后平卧于手术台上，眼部点麻醉药物滴眼液后，使用飞秒激光仪切削患者角膜组织，改变角膜曲率，从而达到矫正近视的作用。
患者在进行飞秒激光矫正近视手术前，需要先通过做验光检查、角膜地形图检查等来获取详细的各项手术相关参数。
手术开始前会在患者眼部点麻醉药物滴眼液，例如盐酸丙美卡因滴眼液、盐酸奥布卡因滴眼液等麻痹患者眼部的痛觉神经纤维，使患者能够更好的配合手术。
随后患者会平卧于手术台上，睁开眼睛盯住正前方的视标，避免眼球的转动，飞秒激光仪开始运作后会切削患者的角膜基质，从而改变患者角膜曲率，修复患者眼睛的屈光缺陷。一般整个手术过程在5分钟左右就可以完成。