1、手术适应范围：半飞秒更广
全飞秒适合1000度以内近视，500度以内散光。而半飞秒适合1200度以内近视，600度以内散光，另外，600度以内的远视也可以半飞秒矫正，而全飞秒则不行。
2、从角膜伤口来看：全飞秒伤口更小
半飞秒需要在角膜上做20毫米切口，接近一圈，形成一个角膜瓣，把角膜瓣掀起来，再用准分子激光将角膜中间削薄，之后将角膜瓣盖上就好了。而全飞秒手术只需要在角膜上做2毫米的切口，然后通过激光在角膜中间切下来一个透镜，再将这个透镜从切口取出来就好了。
3、日常护理：半飞秒要更注意保护眼睛
由于半飞秒的切口大，手术后第一天要戴一个眼罩，避免角膜被无意中碰到掀开。全飞秒手术后不用戴眼罩。
另外，半飞秒愈合后的角膜安全性和稳定性都没有全飞秒好，比如在打篮球或者生活中无意用指甲划到了角膜，全飞秒没有问题，但半飞秒有可能会把伤口撬开。在一些运动过程中，比如蹦极、潜水、游泳，全飞秒恢复好后没有问题，但半飞秒可能需要多多注意保护眼睛。